西暦2030年、情報ネットワーク化が進む中、犯罪の芽を探し出しこれを除去する攻性の組織が設立された。
内務省直属の独立部隊、公安９課・・通称「攻殻機動隊」である。
彼らの役割は、深刻な電脳犯罪への対処、要人警護、暗殺、政治家の汚職摘発から、凶悪犯罪の捜査にまで、多岐に渡る。
“少佐”と呼ばれるサイボーグ・草薙素子を中心に、９課のメンバーはネットの闇に潜む犯罪に敢然と立ち向かっていく。
第17話「未完成ラブロマンスの真相 ANGELS' SHARE」
第18話「暗殺の二重奏 LOST HERITAGE」
第19話「偽装網に抱かれて CAPTIVATED」
第20話「消された薬 RE-VIEW」
第21話「置き去りの軌跡 ERASER」
第22話「疑獄 SCANDAL」
第23話「善悪の彼岸 EQUINOX」
第24話「孤城落日 ANNIHILATION」
第25話「硝煙弾雨 BARRAGE」
第26話（最終話）「公安９課、再び STAND ALONE COMPLEX」
